Najviše tijelo upravljanja je Skupština. Izvršno tijelo Skupštine je Izvršni odbor. HMD ima predsjednika, potpredsjednike od kojih je jedan zadužen za financije i tajnika, te Sud časti.
Broj potpredsjednika utvrđuje Skupština.
Etički kodeks
Na redovnoj sjednici Skupštine HMD-a 23. ožujka 2013. jednoglasno je prihvaćen “Code of Practice” (Etički kodeks) koji je donijelo Etičko povjerenstvo EMS-a u listopadu 2012.
Plan ravnopravnosti spolova
Na sastanku Izvršnog odbora HMD-a 9. studenog 2022. godine jednoglasno je prihvaćen dokument Plan ravnopravnosti spolova.
